慈濟醫院係證嚴 上人感於「貧因病起，病由貧生」，蓽路藍縷、辛苦籌建，於1986年8月終於正式落成啟業，本著「人本醫療，尊重生命」的宗旨，擔負起花東地區急、重症後送的醫療重擔，並於1999年通過衛生署醫學中心評鑑，成為台灣東部重要的醫學中心。
慈濟醫院擁有超過 300 名專科醫師及800 名護理人員，其專業分屬於器官移植、雷射醫學、高科技健康檢查、癌症治療、骨髓幹細胞移植、人工生殖及各類微創手術等，各科醫護團隊獲得多項榮譽認證，成立以來亦獲多項醫療奉獻獎肯定。慈濟醫院同時積極投入各項醫學研發工作，在人工膝關節、中風治療、幹細胞、抗惡性腫瘤等研究項目，取得多項國內專利認證。
近年來更是大力推動脊髓損傷細胞治療、惡性腫瘤治療、骨髓幹細胞移植與免疫細胞和溶瘤病毒治療、全方位整合型中醫、婦科微創手術與不孕症、心臟微創手術、骨科與軟組織醫美再生醫學、膀胱泌尿困難疾病、乳房醫學、重粒子等十大特色醫療，服務更多有需要的病患。
自2001 年開始，慈濟醫院便陸續接受來自國際的轉介病患，於海外亦有長期服務的資深志工團隊以及國際慈濟人醫會組織，全程協助國際間需要幫助之病患。本院國際醫療服務中心設有專業的協調員，除了協助您就醫看診的流程，也針對國際病患及家屬提供了許多便利的服務（包含觀光、旅遊規劃）和通訊設備的協助（包括電話、傳真、網路等）。只要您有任何醫療保健的需求，本院將提供您最先進的醫療技術及高優質的醫療服務團隊。