三灣五穀廟庫建廟於清咸豐元年(1851)，信士陳氏捐地三百坪建立廟宇，並自竹南五穀宮奉迎神駕供奉，惟初建廟宇簡陋，迨民國24年台灣大地震，中間經過多次改建，直至69年農曆5月11日，恭迎神農大帝及眾神像登龕鎮座。 於民國73年農曆11月12日起，隆重舉行慶成圓滿福醮法會大典，此盛況成為三灣鄉境近百年來大事之一。 五穀大帝也就是神農氏，祂發現稻穀，教導人民耕種，栽植蔬菜，奠定我國數千年之農業基礎，造福民眾，後人尊稱五穀大帝真仙，或五榖先帝，福生無量大天尊，五穀大王尊等，鄉民對五穀神農大帝的虔誠，可見一斑。