前身與命名
國防醫學院於民國38年在烽火遍野、共軍渡江之中，自上海遷台，一群最受尊敬、來自協和與湘雅醫學院之臨床老教授們，為了生活窮困逼迫而在廣州街陸軍總醫院旁邊，臨時搭建了一幢鐵皮活動房屋，林可勝院長以「國防醫學中心」的“中心”二字為診所定名，民國38年3月1日「中心診所」誕生於廣州街陸軍總醫院旁，院址座落於水源（思源）路現址。
中心診所遷址
民國59年10月 張祖棻董事長發起籌設「新中心診所」並遷址於台北市忠孝東路現址，共有64位合夥人共同努力分工合作，共同創辦新院，其中在諸多友人及善心人士援助下，終於在民國62年3月1日新院大樓正式營運，服務廣大病友，並更名「中心診所醫院」。
民國98年1月依據新頒醫療法規範，本院更名為『中心診所醫療財團法人中心綜合醫院』
薪火相傳
本院本著「以人為本」的核心價值，不斷的精進醫療知識、技術、設備，提升醫療品質、注重病人安全、醫病關係，做好內外部的溝通，提供親切、便民，持續不斷的有效醫療及健康服務工作。在歷任院長承先啟後的奠基發展下，而具有今日的規模，並持續與台北榮民總醫院及三軍總醫院，維繫著密切的醫療服務合作關係，擁有堅強的醫師陣容，以及緊密的專業合作團隊。