青莲寺是瑞穗的信仰中心。有监於地区信士的需要，今天的青莲寺除了供奉主神释迦摩尼佛祖之外，同祀道教神只，如关帝圣君、妈祖、土地公、注生娘娘等等，可供当地信众膜拜祈福，兼顾民间信仰的寄托。因此，青莲寺也发展出台湾众多庙宇当中少数佛道一家的特殊型式。 而青莲寺这间百年老庙也流传着它独有的传说故事。庙里有一对竹笼，看似普通，其实已经有一百多年的历史，相传在清朝光绪年间，有一位老翁挑了一对竹笼，寄放在打马烟（现瑞北），但过好些日子都没有来领回，当时的乡民打开竹笼後，才发现里头放的是一对佛祖。而且，竹笼内有一张纸条指示笼中佛祖一尊需镇守水尾（瑞穗），另一尊则镇守马太鞍社（光复）。这也就是今天这两座兄弟庙的渊源由来。 民国61年的时候，花莲曾经发生一起大地震，当时还震垮了青莲寺，但庙里的神像及竹笼却都丝毫未损，於是当地居民认为其附有灵气，才能展现神蹟。直到今天，这对竹笼仍是青莲寺的镇寺之宝！ 青莲寺的外观墙面及内部地板都采用瑞穗盛产的蛇纹石为建材，整体建筑散发着瑞穗当地的风格气息。加上完善的管理体制，寺庙内光线充足，气氛庄严却不失亲切。不论在地、外地都有许多信众来访，青莲寺也成为了瑞穗乡民精神及信仰生活的重心。