慈济医院系证严 上人感于「贫因病起，病由贫生」，荜路蓝缕、辛苦筹建，于1986年8月终于正式落成启业，本着「人本医疗，尊重生命」的宗旨，担负起花东地区急、重症后送的医疗重担，并于1999年通过卫生署医学中心评鉴，成为台湾东部重要的医学中心。
慈济医院为器官及组织移植合格医院，且设有心脏介入治疗中心、癌症防治、神经医学科学等中心，以及提供雷射美容、高科技健检等高质量医疗服务，成立以来已获多项医疗奉献奖肯定。慈济医院同时积极投入各项医学研发工作，在人工膝关节、中风治疗、干细胞、抗恶性肿瘤等研究项目，取得多项国内专利认证。