红树林湿地生态公园，位於大鹏湾西方，占地约13.5公顷，主要作为红树林复育使用，邻近社区家庭污水及养殖废水利用自然重力流方式排入，经湿地内红树植物吸收利用後，也能达到净化效果，并且由於丰富红树林生态系统，建构出生态旅游价值。 大鹏湾辖区红树林分布地区主要集中在下列区域: 尖美小镇:探索东港第一排水沟的红树林後，在尖美小镇社区旁可在椰林点缀之红树林丛，在一片翠绿的景致中，认真寻找还可见在泥滩上玩耍觅食的弹涂鱼群。 第一排水沟:沿台17线继续南行，为第一排水沟所在地，亦为红树林生长地带，此处除可观赏红树林生态，另外值得推荐观察的对象就是「招潮蟹」，泥滩上处处可见隆起的小洞，就是这群工兵努力打造的地下城堡，让泥滩上处处充满生态的惊奇体验。 林边排水沟:沿第一排水沟南行，可抵达林边排水沟红树林分布区，此区吸引大批水鸟栖息，为喜好赏鸟者的天堂。 鸟类: 大鹏湾国家风景区出现之鸟种包括候鸟、过境鸟等，鸟种以喜於泥滩湿地活动的鹭科，鹬行鸟科及秧鸡科为主，其中数量最多的是鹭科鸟类;尤以小白鹭为最多，次为友鹭、大白鹭、苍鹭及黄小鹭；鹬行鸟科岛类则以鹬科的云雀鹬、青足鹬及行鸟科的东方环颈行鸟科 、小环颈「行鸟」较多，另外反嘴鹬科的高跷鹬及秧鸡科的红冠水鸡数量亦不少。 海洋类: 大鹏湾目前共发现有网纹招潮蟹、白扇招潮蟹、北方凹指招潮蟹、三角招潮蟹等。雄性招潮蟹有一只明显而巨大之蟹足，这只大蟹足之伸展长度几可达身体甲长之3倍。招潮蟹之体色会随时间及潮汐之变化而变化，白天体色较深、夜间体色较淡。招潮蟹不能适应过於乾燥之环境，其多栖住於大鹏湾之潮间带，於红树林、湾口岸边及沙滩上皆可发现其踪迹。 植物类: 红树林是一群生长在海河沿岸或海河交会处的高木或灌木，一般多分布於热带及亚热带。这些植物通常具有耐盐防风、定砂、缓流、消浪、净化水质、保护堤岸、提供野生动物栖息地及优美环境等功能。本区为台湾红树林分布之南界，目前仅存马鞭草科之海茄苳。分布地区主要集中在东港第一排水沟、奇美小镇区及大鹏湾部份沿岸。