台南是台湾的发源地，正统鹿耳门圣母庙缘起於十六世纪前，因奉祀鹿耳门妈祖而兴建。为台湾唯一奉祀有八百年以上历史鹿耳门妈金身，及建筑面积第一大规模之妈祖庙。现今庙宇共分为五王殿、妈祖殿、佛祖殿、大士殿、天公殿等，仿紫金城宫殿式的北方建筑；每年大年初一起举办新春嘉年华系列活动，以及大年过的元宵高空烟火秀、炸蜂炮、迓春牛游行等活动，人潮络绎不绝！鹿耳门妈祖的活动不仅如此，农历三月廿三日鹿耳门妈寿诞举行白米捐献济贫，虱目鱼料理免费品嚐；每逢丑、辰、未、戌年举行的三年一次的土城香醮；另外庙方附设福德钱、文物馆、文创馆、香客大楼，在在兼顾文化、观光、美食、休闲、慈善，使得正统鹿耳门圣母庙成为台南地区的首屈一指的观光庙宇。鹿耳门天后宫历史概述西元1611年（明永历十五年）鹿耳门妈显灵助涨潮水以利郑成功大军入台降服荷军。西元1162年，荷人投降，郑王为酬谢鹿耳门妈而重建神庙，并增祀随舰护军之文、武馆妈及国圣妈；鹿耳门屿渐成为台湾门户，跃为军商重镇，鹿耳门妈的地位益形崇高且神威显赫，屡显圣迹。西元1831年（道光十一年）曾文溪泛滥，圣母庙遭洪水冲毁，鹿耳门妈等神尊於是寄祀三郊海安宫。西元1918年（民国七年）二建圣母庙落成安座，并将寄祀海安宫之鹿耳门妈等七十余神尊迎回奉祀。西元1913年（日、大正二年）泉州富美宫流放一艘五府千岁王船途经险恶台湾海峡停靠土城沿海，经妈祖灵示为邀请来护佑万民，於是土城民众迎回筑一王宫奉祀。西元1916年（大正五年）前往迎回因古圣母庙受洪患临时寄祀三郊镇港海安宫之鹿耳门妈等七十余尊神像。西元1918年（大正七年）二建神庙落成，名为保安宫，直到1960年才更名为《鹿耳门圣母庙》。西元1981年，历经多次维修重建，在妈祖神威庇佑下，三建神庙终於落成。