清道光廿年(西元1840年)，中国及英国因为贸易不平等爆发「鸦片战争」，虽然「鸦片战争」在本质上是个「通商战争」，但是战败的中国因此产生剧变，史学家以此事件作为中国近代史开端。道光廿二年(西元1842年)，中英两国签订了「中英南京条约」，除了割让香港之外，中国的通商口岸也从原本的广州之外再增加了厦门、福州、宁波和上海，史称「五口通商」，之後欧美等国也订立条约取得同样的权利。为了保障各国船舰在各通商口岸间来往通商的安全，清同治八年(西元1869年)清廷延揽英国籍工程师韩得善(David Marr Henderson)在沿海地势险要的地点设置助航设备。「乌坵」的地理位置恰巧位於厦门及福州两个通商口岸间，扼守湄州湾及兴化湾口，地理位置重要，因此同治十三年(西元1874年)在韩得善的规划设计及哈尔定(Johh Ropinald)的监造下，从上海运来构材，在大坵之顶，海拔一百公尺处建造灯塔，也就是现在的「乌坵灯塔」。现在乌坵灯塔的塔身上可以看到一块红色的区域，上面用黄色写了「D.M.HENDERSON ENGINEER 1874」，1874年则是灯塔完工的时间。二次世界大战期间，日本人在西元1943年～1945年占领乌坵，并住在灯塔内，此时灯仍正常运作。日军投降前，美军飞机轰炸日军船只及灯塔，灯塔塔顶及灯具毁损，灯塔高度也因此降低。日军撤出乌坵时采坚壁清野政策，炮击乌坵灯塔，直到民国34年，英国人才修复受损的乌坵灯塔。民国37年(西元1948年)国共战争期间，乌坵灯塔严重受损，灯塔管理人员因此调离乌坵，到台湾工作，直到灯塔修复後才回到乌坵。这次整修，把石油灯改成五等电灯。民国40年(西元1951年)因为战略需求，灯塔停止点灯，但是油漆及保养工作仍持续进行。民国41年至43年数次台海战争将灯具毁损，後虽修复，灯塔仍未放光。民国59年到64年间(西元1970年～1975年)，军方开始修建灯塔，提高围墙高度，并将石材以水泥材料加固，并在内侧沿墙边兴筑房舍，灯塔入口也由前海军总司令黎玉玺将军命名为「忠义门」。民国64年(1975年)，军方借用灯塔，将灯具卸下，至此，乌坵灯塔的样貌全然改变，化身成为军事堡垒。