「水堀头」是麻豆最为传奇的地方，出天子、掘石车…的故事，千古传诵，迄今不歇；这里曾是倒风内海的汊港，留下水堀头古水道遗迹，倒风内海故事馆的设立，让「麻豆古港文化园区」更具内涵。故事馆本身就充满着故事，如船型的倾斜外观，颇能引人注意，这是埔汉文化交流的意象，表现船只从古港航向海洋，红色砖头则象徵着早期汉人建筑的斗子砌。馆设3楼，1楼展示出土文物及倒风内海情境体验，2楼为麻豆港传说及考古典藏室，3楼则以倒风内海故事为主题，完整诠释倒风内海的人文种种。美丽的港湾不再，但倒风内海的美丽故事，正从古港航向世界……。