位於阿柔村大崙腳地段山區，創建於前清光緒年間，迄今已逾百年歷史，主祀神祇為一塊形似媽祖的風化巨石，鄉民以石媽祖稱之，四周牆圍皆以方形石塊堆砌而成，為深坑區最有的特色廟宇。宮內最大特色，在於主神石媽祖連著神桌及左右二根石柱，皆為同一座長約一‧五公尺且形以鶴狀的石頭公，鄉民稱為白鶴仙師。連接鎮南宮的登山石階步道，建於昭和五年(1930)，約三百八十四階，路旁並立有「石媽祖路碑」以紀錄建築步道的歷史。步道蜿蜒於青山綠林之中，來至廟前廣場時，眼界豁然開朗，幾乎可一覽無遺地俯瞰深坑區景。由深坑街尾過中正橋的產業道路，步行約十分鐘即可到達入口。