在中日战争期间,日本人在南京取走玄奘法师的顶骨舍利,战後送给中华民国佛教协会部分顶骨舍利,1955年迎灵骨来台,1958年安奉於日月潭畔的玄光寺。玄光寺离潭只有十余公尺,寺下设有码头,游客可搭船至码头,再走台阶上去参观;寺内供奉玄奘大师的金身,上悬「民族宗师」匾额;虽然玄奘大师的顶骨舍利已移奉於玄奘寺,但因水路交通便利,玄光寺已是游客到日月潭旅游必访景点。玄光寺的建筑采唐式,因为当初规划为临时安奉玄奘法师顶骨舍利,所以没有碧瓦朱柱映照,显得朴实清雅,反令人发思古之幽情;且因临潭而建,可以就近欣赏日月潭的涵碧秀水,犹如置身於美丽画境中。寺前有一块分别刻有「日月潭」及「玄光寺」的大石头,是游客留下「到此一游」的热门景点;尤其是假日,等着拍照的排队人潮,经常在小小的庙埕绕了好几圈,也形成了另一个有趣的画面。