此處曾經是抵抗日本人侵略的古戰場所在地，石門海拔約370公尺左右的虱母山和海拔約450公尺的五重溪山相對環峙而成，山壁陡峭，中間有孔道通往牡丹鄉。石門古戰場是一處岩石多樹木少的地區，為一處天然險障！沿著小路往山頂走去，路旁可見一石碑題字「澄清海宇還我河山」，讓人不禁對於昔日抗日英雄的凜然正氣倍感敬畏。 牡丹社事件 近因: 1871年(明治4年，同治10年)10月一艘琉球宮古島向那霸上繳年貢的船隻，在回航時遭遇颱風，漂流至台灣東南部八瑤灣(即今之九棚灣)，船上69名乘客溺死3人，有66人登陸，闖入高士佛社(並非牡丹社，如今之牡丹鄉，故牡丹社事件之稱呼並不完全正確)原住民住地，後又因文化認知不同而遭殺害54人，逃過一劫的其餘12人則在當地漢人營救下前往台南府城，由清政府官員安排轉往福州乘船歸國。此類事件在當時不時發生，按慣例皆由中國政府撫卹、送還本國。1873年日本政府外務卿副島種臣前往中國時向總理衙門提起此事時，大臣毛昶熙答覆:「二島(琉球與台灣)俱我屬土，屬土之人相殺，裁次固在於我，我恤琉人，自有措置，何預貴國事，而煩為過問？」日本拿出被害者中有四位小田縣漁民的證據，又追問「貴國既然已知撫卹琉球民，為何不懲辦台番？」，毛以殺人者為置之化外的生番來搪塞，副島便言:「生番害人，貴國置之不理，我國有必要問罪島人，因與貴國盟好，特先來奉告」，毛昶熙不察日使意圖，隨口回答:「(台灣)生番係我化外之民，問罪與否，聽憑貴國辦理。」日本遂抓住這句話柄，向「無主番界」出兵。 戰爭經過: 1874年(清同治十三年)5月10日，日軍於射寮(今屏東縣車城鄉射寮村)登陸。5月18日到5月21日，日軍與台灣原住民有小規模接觸，互有傷亡。5月22日，佐久間左馬太率領日軍150人進抵石門(今屏東縣牡丹鄉石門村)遭到原住民強烈抵抗，最後日軍陸戰隊攀上峭壁居高臨下，情勢逆轉，原住民敗逃，牡丹社酋長阿祿古父子身亡。經此一役，多數採觀望態度的原住民皆靠向日本。6月1日起日軍分三路掃蕩牡丹社、高士佛社、女仍社等原住民，沿途只有小規模抵抗，佔領後焚燒村屋並撤回射寮營地。7月1日，牡丹社、高士佛社、女仍社終於投降。日軍移營龜山(今車城鄉國立海洋生物博物館附近)長期駐紮。