建於西元1661年，主祀保生大帝，是學甲區最大的廟宇，也是學甲人的信仰中心。來到學甲市場邊一定會看見壯觀的慈濟宮牌樓，聞名全台的上白礁祭典就是來自於此，廟內主神像是當年鄭成功部將陳一桂渡海時由漳州的白礁村攜來，傳說這尊攜來的保生大帝神像，是漳州白礁慈濟宮建於北宋時就雕刻的三尊神像之一，彌足珍貴。 每年農曆3月11日是學甲最重要的上白礁謁祖祭典，會在將軍溪畔的白礁亭舉行遙祭祖廟白礁慈濟宮的儀式，是台南重要的文化資產。此外，慈濟宮還有葉王交趾陶文化館，台灣著名交趾陶藝師葉王曾在西元1860~1862年間修建慈濟宮，也因此得以典藏200多件的葉王交趾陶作品，是值得一看的珍貴資產。