驻立於淡水礼拜堂旁,简朴中带有些许岁月痕迹的沪尾偕医馆,是中西合并的建筑,可说是台湾医学的发祥地,现为市定古蹟。西元1879年由同姓的马偕妇人为纪念已逝的先生-马偕船长,并且也感念马偕博士的无私服务精神,因此捐助经费,兴建沪尾偕医馆。其建筑风格是采中式的斜坡屋顶,闽南式屋宅搭配西式的窗框设计,内部设有壁炉,亦属当时西方人习惯使用的家庭必要设备之一。很难想像,这样朴实的建筑内,曾是发现世界首例「肺蛭虫」的医疗院所。清中法战争时,此处更成为在地的医护所,曾荣获刘铭传加以表扬。後因扩充规模,西元1912年,沪尾偕医馆迁移到现今台北市中山北路上的马偕纪念医院现址。今日沪尾偕医馆经整修後,内部除展示马偕博士生平事蹟外,更设有马偕咖啡馆,让古蹟空间再活化利用。沪尾偕医馆为马偕亲自设计,屋体为闽南式民宅,却结合西洋门窗的外貌,极富趣味。由於面对河滨无门埕,因此在形式上采用倒三合院的格局,目前医馆仍保持初建之样貌,馆内并保有一些马偕博士行医时之医疗器材。