创建於1662年(明永历十六年),为台湾最早的民设妈祖庙。郑成功来台後,感恩昔日妈祖庇佑郑军顺利登港,将开基天后宫易茅为瓦,易寮为庙,1662年正式创建,冠以「开基」。因为不及大天后宫的规模及宽敞,俗称「小妈祖庙」。 今之开基天后宫,是一座二进纵深式建筑,坐东朝西。第一进为前殿,第二进为带拜亭的正殿,但因拜亭与前殿之间,没有内埕分隔,混然成为一体。 正殿供奉妈祖神像,左右配祀千里眼、顺风耳两将军神像,第三进为後殿,祀观世音菩萨。天后宫内存有古匾数方,如:乾隆四十四年的「海天福主」、嘉庆十三年的「慈慧」以及道光二十年的「天上福星」等,其中尤以文苑昼画家一峰亭林朝英手书,笔力劲秀,最为人称道。此外,殿内一对石雕蟠龙柱,以三爪降龙为纹,朴拙简练,刀法浑厚有力,不仅是天妃时期的代表,也是石雕艺术的佳作。