1652年为荷兰人所建,初称为「普罗民遮城」,为行政商业中心。建筑为三座略为方形的台座相接而成,1886年改建成飞檐红瓦,有文昌阁、海神庙和蓬壶书院等,自创建之初迄今三百多年来,楼房之增修次数颇多,然其於台南市所扮演之角色,却一直是十分重要。 现存之赤崁楼,由南面的庭园、北面之阁楼及西面蓬壶书院所组成,庭园草木扶疏,立有国姓爷受降之雕像,靠阁楼之墙基土,则立有九块石龟之御碑,其是移自於大南门城边,为清乾隆五十三年〔一七八八〕年赞赏平定林爽文之役之记功碑,碑以花岗石所雕,碑首雕双龙,碑文满汉各四边,二者合壁一篇,所有碑是立於状似石龟之贔屭上,其为九龙生子之一,生好负重,然由於其貌与龟无异,一般人均称之为〔龟碑〕。 现有两栋闽南式阁楼,是立於原普罗民遮城改建之基座上,原有城堡相当的小,上有主要建筑一座,南北则各有望楼,目前荷兰时期之城堡只遗留西面之门及东北角之残蹟二处,从其中,可以清楚的看到砖材之叠砌,这些砖材来自於印尼爪哇岛,并以糯米汁、糖浆、砂与牡蛎壳之混合物为灰浆。 阁楼之中,海神庙位於南面,文昌阁位於北面,二者屋顶均是重檐歇山的表现,重檐之间实即为二楼部分,绕以绿釉花瓶栏杆。海神庙目前悬以〔赤崁楼〕门匾,内部当作赤崁楼之展示馆,东面之花瓶形门洞,相当别致。 文昌阁目前仍悬有沈受谦所题文昌阁匾,一楼亦做为展示之用,二楼则祀魁星,右手握朱笔,左手拿墨斗,一足踏鳖首,一脚踢星斗,以象徵独占鳌头之意。二栋建筑皆位於台基之上,台基中间均有龙形御路设置,墙面则开书卷形之窗户。 二楼阁中间现有一古井,传说中可通往热兰遮城,是真是假,留待游人自行想像。整座高起之基座周围,砌以砖造栏杆,南面之栏杆还立有可爱之小石狮。 南面基墙则砌以历代石碑甚多,西面庭园中亦布满石马、石陀与技勇石等历史文物。蓬壶书院之门厅是该书院留存较具原貌之清领时期建筑,面向西面,装修简朴,值得一览。