內溝溪源發於標高450公尺的內湖坑頭山，向東南流經內溝溪後，轉向南湖大橋上游約500公尺處流入基隆河，全長6817公尺，流域面積約422公頃，集水區平均坡度約41％，為台北市內頗具山林野趣的區域，且利用塊石疊砌形成孔隙，提供水生動物棲息空間，也增加民眾親近溪水機會。內溝溪上游發源自五指山麓，向下注入基隆河，係基隆河之重要支流，全長5.5公里，流域面積約7平方公里。因以近生態工程整治，使生態能保留得較為完整、自然，並營造親水空間，使內溝溪兼具生態保育、教學、休憩等多重功能。內溝溪生態豐富多樣，加上附近又有白鷺鷥山、康樂山、明舉山等多條親山步道可以親近自然，本展示館以內溝溪附近的生態資源做為展示重點，並提供解說服務，做為中小學生及市民的生態教育學習場所。部分資料來源：臺北市政府工務局大地工程處