据传鲲鯓古地，形势犹如雄据台江之巨龙，「四鲲鯓龙山寺」坐巨龙头身，分属庄社的「顶头」和「下头」两处的石井「大井脚」则分别置於庙的两侧十余丈，井水清澈有如龙目一对，遂命名为「龙目井」，历史约300年以上。两井井水清澈、水质甘美，泉源涌出、经年不涸，自来水尚未装设前(1968年前)，一直是「鲲鯓人」日常生活中的最爱。龙目井本身为座西向东的建筑，在其南北侧各有一口自然涌泉的龙目井；当地居民称南边为虎井、北边为龙井，相传受到祖师公指示而开发。从庙口前出发，沿着右手边的104巷进入，在弯曲的古厝间，尽量靠右边前行，约略100公尺後便能到达南边的虎井。近年来虎井早已混浊，为了保障当地居民的安全，两口龙目井都有做加高的处理，以防民众掉入。而沿着虎井绕聚落，不久便会绕至龙山寺後方，沿着194巷继续往北，就可以抵达龙井。龙井的水质甘甜清澈，地方居民使用率高，因此不易乾枯。观察两口井的外围，发现都做有略低的沟道与排水口，目的是方便早期妇女取井水洗衣物。