陽明高雄海洋探索館是一棟擁有遊輪造型的兩層樓建築物，特殊的船體造型，彷若一艘停泊於高雄港內的大船，與航道上往來的貨櫃輪、漁船和偶而來回穿梭的軍艦交織成一幅美麗的港灣風情。展館一樓規劃有兩個特展展覽室，另有3D立體電影院，只要戴上立體眼鏡，馬上就能享受3D電影的震撼。陽明高雄海洋探索館是一個認識海洋文化活教材最佳的優質場域，更是一個享受心靈極致的海洋美學殿堂。展館二樓規劃為觀景區，該區是坐擁探索館最佳的觀景平台，能愜意的欣賞美麗的高雄港和旗津漁港，更可以眺望高雄市區的天際線，靜靜的享受悠閒寧靜的時光，體會恬靜自適的氛圍。