鵬村濕地面積約10公頃，位於林邊鄉及東港鎮交界處，原為軍事營區使用地，基地旁有大潭里東側無名溝渠(區外污水截流)、南埔埤支線及海豐埤支線等三條明溝經過；此濕地主要將大潭里東側社區、南埔埤支線及海豐埤支線排水先引進鵬村濕地內，利用自然淨化功能減低污染量後，再排放至大鵬灣潟湖。濕地設計主要以表面流為主，並以深、淺埤塘來創造出多樣的棲地空間，為了增加處理效率，在濕地沉澱池後段，增設潛流式濕地系統，幫助去除水中大部分的污染物。進水後先經由沉澱池與介質床的前處理，之後進入一系列的表面流濕地最後至出水口，基地初步配置如圖。