紅樹林濕地生態公園，位於大鵬灣西方，佔地約13.5公頃，主要作為紅樹林復育使用，鄰近社區家庭污水及養殖廢水利用自然重力流方式排入，經濕地內紅樹植物吸收利用後，也能達到淨化效果，並且由於豐富紅樹林生態系統，建構出生態旅遊價值。 大鵬灣轄區紅樹林分佈地區主要集中在下列區域: 尖美小鎮:探索東港第一排水溝的紅樹林後，在尖美小鎮社區旁可在椰林點綴之紅樹林叢，在一片翠綠的景緻中，認真尋找還可見在泥灘上玩耍覓食的彈塗魚群。 第一排水溝:沿台17線繼續南行，為第一排水溝所在地，亦為紅樹林生長地帶，此處除可觀賞紅樹林生態，另外值得推薦觀察的對象就是「招潮蟹」，泥灘上處處可見隆起的小洞，就是這群工兵努力打造的地下城堡，讓泥灘上處處充滿生態的驚奇體驗。 林邊排水溝:沿第一排水溝南行，可抵達林邊排水溝紅樹林分佈區，此區吸引大批水鳥棲息，為喜好賞鳥者的天堂。 鳥類: 大鵬灣國家風景區出現之鳥種包括候鳥、過境鳥等，鳥種以喜於泥灘濕地活動的鷺科，鷸行鳥科及秧雞科為主，其中數量最多的是鷺科鳥類;尤以小白鷺為最多，次為友鷺、大白鷺、蒼鷺及黃小鷺；鷸行鳥科島類則以鷸科的雲雀鷸、青足鷸及行鳥科的東方環頸行鳥科 、小環頸「行鳥」較多，另外反嘴鷸科的高蹺鷸及秧雞科的紅冠水雞數量亦不少。 海洋類: 大鵬灣目前共發現有網紋招潮蟹、白扇招潮蟹、北方凹指招潮蟹、三角招潮蟹等。雄性招潮蟹有一隻明顯而巨大之蟹足，這隻大蟹足之伸展長度幾可達身體甲長之3倍。招潮蟹之體色會隨時間及潮汐之變化而變化，白天體色較深、夜間體色較淡。招潮蟹不能適應過於乾燥之環境，其多棲住於大鵬灣之潮間帶，於紅樹林、灣口岸邊及沙灘上皆可發現其蹤跡。 植物類: 紅樹林是一群生長在海河沿岸或海河交會處的高木或灌木，一般多分佈於熱帶及亞熱帶。這些植物通常具有耐鹽防風、定砂、緩流、消浪、淨化水質、保護堤岸、提供野生動物棲息地及優美環境等功能。本區為台灣紅樹林分佈之南界，目前僅存馬鞭草科之海茄苳。分佈地區主要集中在東港第一排水溝、奇美小鎮區及大鵬灣部份沿岸。