據清代林焜熿《金門志》記載，燕南書院為金門地區最早成立的書院，其引《滄浯瑣錄》云：「朱子主邑簿，採風島上，以禮導民，浯既被化，因立書院於燕南山，自後家絃戶誦，優游正義，涵泳聖經，則風俗一丕變也。」又云：「燕南書院在浯州，宋時建，今莫詳其蹟。」 金門燕南山因宋朝朱熹興建「燕南書院」而聞名，燕南書院是朱子在金門的講學處，也是金門最早的文教聖地，帶動了金門的文風，讓金門在明、清兩代產生了不少進士。太文巖寺則與太武山海印寺、田浦城隍廟、金城南門香蓮廟、庵前恩主公廟，並稱金門五大名廟。 金門縣政府為恢復振奮浯島文化靈魂，乃於舊址謀畫興復之可能。民國94 年由金門縣文化局主持其事，先委請中國科技大學完成「金門縣燕南書院『含清水祖師廟』興建計畫之復建評估研究調查計畫」，確認燕南書院的文化資產價值，燕南書院和太文巖寺舊址，因居高臨下，可以鳥瞰金城鎮一帶的風光，民國95 年登錄為金門的文化景觀之一，揭示傳承歷史，繼起文化之決心。