位於台北植物园内的钦差行台，内政部於民国74年8月19日公告为台闽地区第二级古蹟，进入头门（大门）後，再穿过仪门，即可抵达後面大堂。头门及仪门有左右厢房连接，仪门与大堂间则有左右侧廊及中廊相连，形成两个相连的四合院。由於是官署建筑，建筑素雅稳重，格局宏整，室内高敞，表现了清代官衙之威严与气势。 西元1884年（光绪10年）中法战争奠定了台湾在战略位置上的重要性，隔年西元1885年（光绪11年）由清朝慈禧太后正式下诏台湾建省，并指派刘铭传为首任台湾巡抚同时兼管福建巡抚事务。西元1889年（光绪15年）巡府刘铭传因应省城布政使司衙门尚未建成前，为了让布政司有一个临时办公场所而设的衙署建筑座落位置在台北城的西北隅，也就是今天的台北市警察局与中山堂及前面广场的位置。 西元1892年（光绪18年）为了使巡府衙门及布政使司衙门接待外来的官员有栖身场所并作为长官宴会的地方，特别在衙门的右辕增建一座规模较小，其建材及造型都较布政司衙门考究的建筑招待所名为『钦差行台』於西元1894年完工。同年7月『中日甲午』战争爆发；西元1895年签订马关条约割让台湾，而当时担任清廷巡抚唐景崧则在5月宣布『台湾民主国成立』以巡抚衙门作为当时的总统府，以『钦差行台』则作为『筹防局』，主筹战争的一切应急事物，这也就是现存保存於台北植物园内的建物厅舍。同年6月日军登台攻陷基隆，总统唐景崧逃亡，总统府（巡抚衙门）惨遭祝融，台北城就此沦陷。日本皇族北白川宫能久亲王进城，则以布政使司衙门作为御住营地，而以钦差行台为『台湾总督府』，历经有七任总督在此地办公。 直到西元1919（大正8年）总督府新设厅（现今凯达格兰大道尽端的总统府）正式完工才搬迁，成为台湾最高权力机构的所在地。西元1932年，日本政府为了兴建台北市公会堂，又考量古蹟保存的重要，决议将布政使司衙门拆除拆成三部移地保存，一部是移至台北动物园〈圆山，现已拆除〉，一部是移至净土宗台北别院〈善导寺．现已拆除〉，另一部则迁移到台北植物园（现已保存为钦差行台）。