祀典兴济宫创建於明永历年间(1648~1683),主祀保生大帝,旧称「大道公宫」、「顶大道公庙」等,为现存台南府城五间「祀典庙宇」之一。保生大帝为北宋名医,以医术高明、慈善济人着称,世人尊为神医,飞昇之後,屡有显灵、济弱扶倾,自宋以来,历代均有褒封、加冕;迄明代洪熙年间,因医治皇太后有功,正式晋封为「万寿无极保生大帝」。庙为三开间三进,檐饰剪黏华丽而富变化,充分展现闽南式庙宇建筑特色;三川步口壁堵以双龙纹饰构成「福、禄」二字,充分表现中国文字线条美感;亦有蝙蝠飞舞,象徵天降祥福;或松树祥鹤,意味松鹤延年等吉祥含意。另有同治十年(1871)镌刻之龙柱,雕工精巧生动、层次分明,单龙盘柱,刚劲有力;石狮雄踞大门,既有固定门轴、门柱及门槛之功用,兼具镇护作用,常有信徒献上糕饼,祈求护佑孩童头壳硬、身体壮,为本宫重要民俗特色之一。而中门则绘有秦叔宝、尉迟恭,左右侧门绘三十六官将护卫庙堂,此皆出於薪传奖民俗艺师陈寿彝之手。步入庙堂,首见光绪八年(1882)台湾府知府周懋琦所撰对联:「秉笔陋元臣医药神灵宋史漏收方伎传,熙朝修祀典馨香朔望清时合祭观音亭」,并详述清同治、光绪年间,钦差大臣沈葆桢奉旨来台「开山抚番」,而兴济宫保生大帝护佑官兵,免於灾病,乃奉旨祀典,谕令官员「朔望拈香,春秋致祭,以答鸿庥」,成为台湾唯一一座名列祀典之保生大帝庙。庙内另珍藏诸多清代古匾,其中又以道光十五年(1835)太子少保王得禄所立之「保爱生民」最负盛名。由於保生大帝精通医术、妙手回春,庙内除了一般运签外,更设有眼科、外科、小儿科及大人内科等药签,共计三百余首,供信徒求方治疗。正殿见保生大帝持笏端坐其上,胁祀江仙官、张圣者,配祀敏明姑娘、王舍人姑爷,案桌旁配祀下坛将军-虎爷,因受大帝感化而被收为部属,其具有医治孩童腮腺炎、除煞、收惊及招财神力,相当受信徒欢迎。左右分祀五营将军及福德正神;後殿为圣父母厅,供奉大帝圣父「敕封圣父讳通协成元君」、圣母「敕封圣母黄氏玉华大仙」神位,亦祀三官大帝、南、北斗星君、关圣帝君、太岁星君及文昌帝君,呈现民间多神信仰特色。左右壁堵彩绘泥塑「三十六官将」,或骑或飞、栩栩如生,宛若腾空而出,为本宫一大艺术特色。